54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4723 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4723  SH3 type 3 domain-containing protein  100 
 
 		 589 aa  1005    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0494815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4134  SH3 type 3 domain-containing protein  41.18 
 
 		 312 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.310426 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4232  SH3, type 3  41.18 
 
 		 312 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4419  SH3 type 3 domain protein  41.18 
 
 		 224 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4099  SH3 type 3 domain protein  41.46 
 
 		 232 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3385  SH3 type 3 domain-containing protein  38.97 
 
 		 301 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4458  SH3 type 3 domain-containing protein  36.99 
 
 		 281 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4026  SH3 type 3 domain-containing protein  40.37 
 
 		 289 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3959  SH3, type 3  41.35 
 
 		 214 aa  94  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2633  SH3 type 3 domain protein  40 
 
 		 316 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1900  SH3 domain-containing protein  40.44 
 
 		 275 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00351157  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3545  SH3 type 3 domain-containing protein  36.25 
 
 		 283 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0621  SH3 type 3 domain-containing protein  41.46 
 
 		 220 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  48.87 
 
 		 2397 aa  90.5  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3964  hypothetical protein  40.8 
 
 		 287 aa  88.2  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8097  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like protein  34.43 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1032  SH3 type 3 domain-containing protein  40.14 
 
 		 259 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.545598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0168  SH3 type 3 domain protein  43.43 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7236  hypothetical protein  32.34 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  34.55 
 
 		 1859 aa  70.9  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2733  SH3-like region  34.51 
 
 		 184 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.927478  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.45 
 
 		 2449 aa  67.8  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2565  SH3 type 3 domain-containing protein  42.17 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0409  hypothetical protein  47.86 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282348  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0736  hypothetical protein  38.27 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1461  hypothetical protein  32 
 
 		 193 aa  63.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2765  SH3 type 3 domain protein  34.81 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.762537  normal  0.784526 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  37.84 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1587  translation initiation factor IF-2  42.71 
 
 		 1128 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.73073  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0733  hypothetical protein  37.68 
 
 		 100 aa  58.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  36.94 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16981  translation initiation factor IF-2  42.39 
 
 		 1126 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  53.98 
 
 		 1049 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  32.29 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  34.87 
 
 		 606 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  35.29 
 
 		 210 aa  54.7  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  32.02 
 
 		 492 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1511  hypothetical protein  27.66 
 
 		 193 aa  54.3  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2081  translation initiation factor IF-2  38.67 
 
 		 1104 aa  54.3  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  26.67 
 
 		 326 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  30.43 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3121  mucin 17-like protein  39.08 
 
 		 1788 aa  51.2  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0592  translation initiation factor IF-2  38.6 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  58 
 
 		 863 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  33.86 
 
 		 380 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1246 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5216  OmpA/MotB domain protein  41.98 
 
 		 723 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 939 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  34.92 
 
 		 221 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  34.92 
 
 		 221 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.87 
 
 		 925 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  31.63 
 
 		 225 aa  44.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03032  putative GPI-anchored protein (Eurofung)  44.83 
 
 		 432 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13899  hypothetical protein  39.13 
 
 		 402 aa  44.3  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>