91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1050 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  64.06 
 
 		 1058 aa  878    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 1246 aa  2533    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1897  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1261 aa  230  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0708116  normal  0.0322802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1442 aa  227  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1333 aa  221  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0934  hypothetical protein  38.08 
 
 		 1320 aa  211  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  31.75 
 
 		 1403 aa  173  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  32.83 
 
 		 1627 aa  157  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1448 aa  154  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3926  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1428 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788983  normal  0.421354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3928  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1635 aa  150  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4765  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1216 aa  144  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  37.02 
 
 		 1200 aa  135  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  37.57 
 
 		 1202 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1930  hypothetical protein  29.21 
 
 		 377 aa  115  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  39.53 
 
 		 280 aa  112  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  46.97 
 
 		 309 aa  107  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 630 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  45.61 
 
 		 274 aa  99  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 974 aa  99  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1126 aa  96.3  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  36.96 
 
 		 1319 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  29.97 
 
 		 503 aa  92.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  46.88 
 
 		 239 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  40.2 
 
 		 405 aa  89.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  27.27 
 
 		 222 aa  88.6  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.73 
 
 		 554 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  35.03 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  50 
 
 		 569 aa  86.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  41.75 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  84.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  44.05 
 
 		 242 aa  81.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  42.31 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  44.16 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  41.18 
 
 		 693 aa  79  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1060 aa  79  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  42.31 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  40.66 
 
 		 620 aa  78.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  41.67 
 
 		 224 aa  77.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  40.26 
 
 		 1086 aa  75.5  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  37.61 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  34.11 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  38.66 
 
 		 238 aa  73.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  42.17 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  41.46 
 
 		 968 aa  72.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  37.38 
 
 		 723 aa  69.7  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  40.91 
 
 		 923 aa  68.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 756 aa  67.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1137 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  30.83 
 
 		 582 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  39.36 
 
 		 184 aa  66.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  44.58 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  40.91 
 
 		 313 aa  64.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  31.25 
 
 		 922 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  37.62 
 
 		 1217 aa  63.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  31.52 
 
 		 234 aa  63.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1309 aa  63.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  36.36 
 
 		 639 aa  62.4  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  38.82 
 
 		 2221 aa  61.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1198 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  36.36 
 
 		 909 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  38.27 
 
 		 1219 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  33.75 
 
 		 595 aa  59.7  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1109 aa  59.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  37.84 
 
 		 935 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  38.55 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1081 aa  58.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  36.36 
 
 		 896 aa  58.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  35.65 
 
 		 3036 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  33.77 
 
 		 409 aa  56.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  36.36 
 
 		 197 aa  55.1  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.46 
 
 		 954 aa  55.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.32 
 
 		 913 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0926  hypothetical protein  31 
 
 		 108 aa  52  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0424776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  40.58 
 
 		 466 aa  50.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1146  Mu-like phage minor tail protein  25.19 
 
 		 1137 aa  50.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 		 534 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3796  hypothetical protein  34.02 
 
 		 855 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  36.11 
 
 		 621 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3763  hypothetical protein  22.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  31.33 
 
 		 642 aa  48.5  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  33.8 
 
 		 866 aa  48.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  36.46 
 
 		 608 aa  48.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1637 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4350  hypothetical protein  30.43 
 
 		 936 aa  47  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1503 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3203  hypothetical protein  24.39 
 
 		 246 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  32.47 
 
 		 632 aa  45.8  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  23.87 
 
 		 784 aa  45.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  36.9 
 
 		 609 aa  45.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0593  lipoprotein (VmcD)  25.22 
 
 		 309 aa  45.1  0.009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>