36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2240 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  100 
 
 
3036 aa  5898    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2242  hypothetical protein  82.93 
 
 
369 aa  566  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00590852  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2244  hypothetical protein  73.71 
 
 
370 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0590554  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  31.5 
 
 
1627 aa  111  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  60 
 
 
486 aa  91.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  58.67 
 
 
1637 aa  90.5  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  58.67 
 
 
1503 aa  90.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  51.65 
 
 
1545 aa  90.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  51.65 
 
 
1420 aa  90.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  38.93 
 
 
234 aa  70.5  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3926  hypothetical protein  46.51 
 
 
1428 aa  68.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788983  normal  0.421354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3928  hypothetical protein  46.51 
 
 
1635 aa  69.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  43.9 
 
 
239 aa  68.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  47.44 
 
 
1448 aa  68.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  37.38 
 
 
1217 aa  66.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  47.3 
 
 
1058 aa  65.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  35.71 
 
 
1137 aa  64.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  23.98 
 
 
1393 aa  64.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  35.85 
 
 
534 aa  63.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  40.26 
 
 
258 aa  63.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  36.04 
 
 
1309 aa  63.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  36.61 
 
 
643 aa  63.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2595  hypothetical protein  40.35 
 
 
160 aa  62.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277016  normal  0.0631654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  32.09 
 
 
922 aa  60.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  33.01 
 
 
925 aa  58.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  32.03 
 
 
1109 aa  58.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  30.82 
 
 
1219 aa  59.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.64 
 
 
913 aa  56.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  32.67 
 
 
1465 aa  53.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  24.94 
 
 
1442 aa  53.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  23.25 
 
 
755 aa  52.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  35.83 
 
 
238 aa  50.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  34.62 
 
 
1081 aa  48.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  25.77 
 
 
1090 aa  48.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  41.67 
 
 
813 aa  46.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0812  band 7 protein  30.61 
 
 
468 aa  46.2  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>