More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3055 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 534 aa  1082    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1403 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1333 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  47.87 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  47.67 
 
 		 756 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  42.11 
 
 		 503 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  52.11 
 
 		 1086 aa  71.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  35.04 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  45.16 
 
 		 224 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  41.98 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  42.57 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  49.38 
 
 		 1137 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  39.77 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1126 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.69 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  41.76 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  56.9 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  55.17 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  49.41 
 
 		 238 aa  62  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.93 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  41.28 
 
 		 1219 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.51 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  38.54 
 
 		 693 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  40.18 
 
 		 922 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  42.22 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  50 
 
 		 935 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  46.38 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  33.06 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  47.3 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.4 
 
 		 222 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  58.18 
 
 		 643 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.32 
 
 		 321 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  38.82 
 
 		 630 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35.09 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.45 
 
 		 974 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  30.83 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0864  OmpA/MotB domain-containing protein  36.49 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  51.67 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  30.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  31.01 
 
 		 195 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  36.28 
 
 		 223 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  35.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 		 224 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1058 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  31.48 
 
 		 233 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.63 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.36 
 
 		 172 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  46.88 
 
 		 1060 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  31.51 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.94 
 
 		 229 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  32.74 
 
 		 215 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  48.21 
 
 		 968 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  33.33 
 
 		 229 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 		 1755 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  44.93 
 
 		 1448 aa  55.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 623 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  29.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  27.88 
 
 		 424 aa  54.7  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  34.45 
 
 		 204 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 215 aa  54.3  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  52.73 
 
 		 235 aa  53.9  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.62 
 
 		 226 aa  53.5  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  35.04 
 
 		 417 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 613 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  54.1 
 
 		 632 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  29.06 
 
 		 240 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1558  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0671389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  31.67 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 290 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  30.61 
 
 		 290 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  41.98 
 
 		 1217 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0926  hypothetical protein  47.56 
 
 		 108 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0424776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  34.74 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  30.17 
 
 		 230 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  30.51 
 
 		 220 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.09 
 
 		 164 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1200 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 		 206 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  35.11 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1842  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 276 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>