13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1897 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1897  hypothetical protein  100 
 
 
1261 aa  2475    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0708116  normal  0.0322802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0934  hypothetical protein  47.58 
 
 
1320 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4765  hypothetical protein  44.72 
 
 
1216 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  32.77 
 
 
1246 aa  229  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  26.61 
 
 
1627 aa  229  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  30.45 
 
 
1442 aa  201  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  33.97 
 
 
1058 aa  192  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  34.63 
 
 
1403 aa  178  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3928  hypothetical protein  24.38 
 
 
1635 aa  177  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3926  hypothetical protein  24.96 
 
 
1428 aa  174  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788983  normal  0.421354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  33.57 
 
 
1448 aa  159  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  28.34 
 
 
1333 aa  145  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1930  hypothetical protein  23.56 
 
 
377 aa  95.9  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>