18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3928 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3928  hypothetical protein  100 
 
 
1635 aa  3245    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3926  hypothetical protein  93.67 
 
 
1428 aa  1892    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788983  normal  0.421354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  51.82 
 
 
1627 aa  877    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0934  hypothetical protein  25.26 
 
 
1320 aa  178  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1897  hypothetical protein  24.96 
 
 
1261 aa  171  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0708116  normal  0.0322802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  29.38 
 
 
1442 aa  169  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  27.65 
 
 
1246 aa  150  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  30.5 
 
 
1448 aa  141  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  24.55 
 
 
1403 aa  135  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  29.67 
 
 
1058 aa  133  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  25.31 
 
 
1333 aa  124  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4765  hypothetical protein  24.79 
 
 
1216 aa  115  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  36.12 
 
 
486 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  34.75 
 
 
1637 aa  92.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  34.36 
 
 
1503 aa  92  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  46.51 
 
 
3036 aa  69.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1930  hypothetical protein  24.9 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2595  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277016  normal  0.0631654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>