18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3926 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3928  hypothetical protein  94.24 
 
 
1635 aa  1895    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3926  hypothetical protein  100 
 
 
1428 aa  2844    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788983  normal  0.421354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  46.35 
 
 
1627 aa  993    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0934  hypothetical protein  24.93 
 
 
1320 aa  179  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.566445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1897  hypothetical protein  24.83 
 
 
1261 aa  174  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0708116  normal  0.0322802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  29.36 
 
 
1442 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  27.97 
 
 
1246 aa  151  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  30.14 
 
 
1448 aa  138  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  30.72 
 
 
1058 aa  135  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  24.55 
 
 
1403 aa  129  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  25.39 
 
 
1333 aa  125  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4765  hypothetical protein  24.37 
 
 
1216 aa  116  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  36.29 
 
 
486 aa  99  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  34.75 
 
 
1637 aa  94  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  34.36 
 
 
1503 aa  93.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1930  hypothetical protein  24.8 
 
 
377 aa  69.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  46.51 
 
 
3036 aa  69.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2595  hypothetical protein  35.92 
 
 
160 aa  45.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277016  normal  0.0631654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>