52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0795 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  100 
 
 		 1109 aa  2169    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  44.68 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  43.59 
 
 		 503 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  38.79 
 
 		 1058 aa  69.3  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1126 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1219 aa  66.6  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  44.74 
 
 		 1200 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  43.75 
 
 		 620 aa  67  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  37.33 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  37.82 
 
 		 534 aa  65.1  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  39.47 
 
 		 1333 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  37.84 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  43.53 
 
 		 1319 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  42.47 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  39.09 
 
 		 1217 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  43.4 
 
 		 896 aa  60.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  40.96 
 
 		 239 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  46.48 
 
 		 935 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1246 aa  59.7  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1202 aa  60.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  41.67 
 
 		 643 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  43.37 
 
 		 238 aa  57.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  39.62 
 
 		 693 aa  57  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  35.58 
 
 		 222 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  43.66 
 
 		 1309 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1448 aa  56.2  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  38 
 
 		 1137 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2441  hypothetical protein  49.18 
 
 		 232 aa  55.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  32.74 
 
 		 3036 aa  54.7  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  47.14 
 
 		 1060 aa  54.3  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  33.53 
 
 		 909 aa  53.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  34.91 
 
 		 968 aa  52.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  43.48 
 
 		 242 aa  52.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1403 aa  52.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  41.43 
 
 		 756 aa  52.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.46 
 
 		 913 aa  52.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  36.59 
 
 		 258 aa  51.6  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  36.84 
 
 		 386 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  40.54 
 
 		 309 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  33.66 
 
 		 363 aa  50.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  44.58 
 
 		 1081 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  39.47 
 
 		 595 aa  49.3  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  48.9  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  43.02 
 
 		 222 aa  48.9  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  39.19 
 
 		 224 aa  48.5  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  32.67 
 
 		 456 aa  48.5  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  37.14 
 
 		 866 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  36.11 
 
 		 486 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  43.48 
 
 		 313 aa  46.2  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1389  hypothetical protein  37.18 
 
 		 268 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.26529  hitchhiker  0.000124146 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1503 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1637 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>