77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2557 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  86.84 
 
 		 1202 aa  2053    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  100 
 
 		 1200 aa  2428    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  40.11 
 
 		 1319 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0992  hypothetical protein  36.34 
 
 		 980 aa  350  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  37.02 
 
 		 1246 aa  135  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  37.1 
 
 		 280 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  33.72 
 
 		 309 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  34.73 
 
 		 274 aa  111  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1126 aa  108  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  51.04 
 
 		 1448 aa  104  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1333 aa  102  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  34.42 
 
 		 386 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  43.7 
 
 		 1058 aa  98.2  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  31.45 
 
 		 503 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  38.1 
 
 		 239 aa  94.7  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  40.74 
 
 		 405 aa  90.5  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 630 aa  90.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.42 
 
 		 974 aa  90.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.75 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  41.75 
 
 		 222 aa  85.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  31.96 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  42.48 
 
 		 693 aa  84.7  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  44.09 
 
 		 1086 aa  84.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  48.05 
 
 		 1060 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 		 756 aa  81.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  41.38 
 
 		 922 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  47.44 
 
 		 1403 aa  79  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1219 aa  78.2  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  36.57 
 
 		 909 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  43.02 
 
 		 258 aa  77  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  47.56 
 
 		 495 aa  77  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  46.34 
 
 		 224 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  48.05 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  41 
 
 		 1137 aa  76.3  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  41.82 
 
 		 923 aa  75.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  45.24 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1198 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  43.3 
 
 		 582 aa  73.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  49.35 
 
 		 2221 aa  73.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  43.82 
 
 		 968 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  48.84 
 
 		 238 aa  72.4  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  34.51 
 
 		 896 aa  71.6  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  40.21 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4244  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1117 aa  71.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  51.61 
 
 		 620 aa  70.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  35.03 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1217 aa  68.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  44.74 
 
 		 1109 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  40.7 
 
 		 935 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  40 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  44.94 
 
 		 184 aa  64.3  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  42.7 
 
 		 234 aa  64.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  43.84 
 
 		 3036 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  38.55 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  33.68 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  35.48 
 
 		 723 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1545 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  41.56 
 
 		 595 aa  61.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  42.7 
 
 		 313 aa  60.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  32.63 
 
 		 456 aa  59.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1420 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.73 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1637 aa  58.5  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1503 aa  58.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  39.76 
 
 		 432 aa  57.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  39.76 
 
 		 449 aa  57.4  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  35 
 
 		 1309 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  39.02 
 
 		 486 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  33.88 
 
 		 632 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  39.76 
 
 		 197 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 534 aa  52.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1081 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0926  hypothetical protein  36.36 
 
 		 108 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0424776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  29.09 
 
 		 642 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  36.25 
 
 		 409 aa  47  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 406 aa  46.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  37.66 
 
 		 466 aa  45.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>