71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0871 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 
632 aa  1273    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0925  SH3 type 3 domain protein  94.51 
 
 
654 aa  1009    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0177917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0926  hypothetical protein  95.59 
 
 
108 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0424776  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  40.96 
 
 
405 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  38.95 
 
 
639 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  47.44 
 
 
756 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  33.64 
 
 
386 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  48 
 
 
1403 aa  63.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  39.39 
 
 
243 aa  62.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  47.3 
 
 
242 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  54.1 
 
 
534 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  38.14 
 
 
456 aa  62  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  45.31 
 
 
222 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  51.47 
 
 
935 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  40 
 
 
503 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  39.53 
 
 
238 aa  58.9  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  45.9 
 
 
968 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  37.11 
 
 
363 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  40.59 
 
 
922 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  40.59 
 
 
1219 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  46.27 
 
 
643 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  47.14 
 
 
1137 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  33.63 
 
 
620 aa  57.4  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  38.6 
 
 
224 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.18 
 
 
954 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  44.78 
 
 
234 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  34.34 
 
 
239 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  51.72 
 
 
693 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  31.78 
 
 
1333 aa  56.6  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  44.29 
 
 
534 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  35.2 
 
 
1200 aa  55.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  37.88 
 
 
280 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  41.18 
 
 
313 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  31.25 
 
 
258 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  43.28 
 
 
495 aa  54.7  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  30.14 
 
 
723 aa  53.9  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  41.18 
 
 
1319 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  44.26 
 
 
1081 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  33.87 
 
 
235 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.33 
 
 
913 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  43.55 
 
 
1060 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  39.18 
 
 
1198 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  46.88 
 
 
1086 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  41.43 
 
 
1309 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  44.29 
 
 
1217 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  43.66 
 
 
595 aa  50.8  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  35.87 
 
 
1058 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  41.79 
 
 
449 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  36.76 
 
 
1126 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  44 
 
 
909 aa  50.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  41.79 
 
 
432 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  40.62 
 
 
1448 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  44.26 
 
 
1637 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6677  hypothetical protein  22.89 
 
 
545 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217849  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  44.26 
 
 
1503 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  32.26 
 
 
1202 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.86 
 
 
554 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 
630 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  33.71 
 
 
569 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  32.47 
 
 
1246 aa  48.5  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  44.26 
 
 
486 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  42.65 
 
 
309 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  41.18 
 
 
274 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  42.19 
 
 
1545 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  39.53 
 
 
197 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  37.5 
 
 
642 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  42.19 
 
 
1420 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  43.24 
 
 
1109 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  41.33 
 
 
896 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 
974 aa  44.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3796  hypothetical protein  43.04 
 
 
855 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>