79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1653 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  63.95 
 
 
309 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  79.17 
 
 
974 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  80.36 
 
 
630 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  80.39 
 
 
554 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  39.74 
 
 
280 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  46.11 
 
 
242 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  41.36 
 
 
1200 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  33.94 
 
 
1126 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  40 
 
 
1202 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  38.74 
 
 
569 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  38.22 
 
 
386 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  37.45 
 
 
495 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  37.11 
 
 
968 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  36.32 
 
 
1060 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 
756 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  49.48 
 
 
405 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  39.68 
 
 
1246 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  57.73 
 
 
1058 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  36.84 
 
 
923 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  37.28 
 
 
1333 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  33.33 
 
 
1319 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  56.1 
 
 
239 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  40.82 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  51.38 
 
 
224 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  45.74 
 
 
1448 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  31.09 
 
 
503 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  52.44 
 
 
258 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  47.31 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  36.56 
 
 
1403 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  51.06 
 
 
184 aa  85.9  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  41.62 
 
 
1198 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  52.27 
 
 
449 aa  82.4  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  50.56 
 
 
1086 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  37.76 
 
 
693 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  51.19 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  51.14 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  45.13 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  54.88 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  44.07 
 
 
922 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  47.31 
 
 
1137 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  47.12 
 
 
643 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  52.56 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  43.22 
 
 
1219 aa  76.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  44.23 
 
 
909 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.19 
 
 
913 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  44.34 
 
 
1217 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  46.07 
 
 
935 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  47.31 
 
 
1309 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  45 
 
 
639 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  50.75 
 
 
620 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  44.19 
 
 
896 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  42.86 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  41.56 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  45.63 
 
 
2221 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  37.74 
 
 
534 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  47.06 
 
 
595 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  38.24 
 
 
582 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  56.9 
 
 
534 aa  62.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  45.24 
 
 
1081 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  36.23 
 
 
723 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  42.86 
 
 
466 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  33.57 
 
 
409 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  45.45 
 
 
197 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  39.76 
 
 
642 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  43.9 
 
 
1637 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  46.97 
 
 
866 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  43.21 
 
 
1503 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  41.89 
 
 
1420 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  41.89 
 
 
1545 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  41.98 
 
 
486 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.75 
 
 
954 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  40.54 
 
 
3036 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  39.76 
 
 
222 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  42.03 
 
 
1109 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0926  hypothetical protein  37.5 
 
 
108 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0424776  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  41.18 
 
 
632 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  43.28 
 
 
545 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  40.58 
 
 
1627 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>