85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1771 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  59.56 
 
 		 723 aa  200  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  56.17 
 
 		 409 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  54.37 
 
 		 258 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  49.12 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  45.05 
 
 		 239 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  49.1 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  47.83 
 
 		 968 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  51.14 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  45.1 
 
 		 1403 aa  78.2  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4350  hypothetical protein  39.2 
 
 		 936 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  46.15 
 
 		 909 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  47.42 
 
 		 569 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  41.91 
 
 		 923 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  50.52 
 
 		 896 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  53.85 
 
 		 495 aa  74.7  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  35.38 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  46.75 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1333 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  40.16 
 
 		 1060 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  43.82 
 
 		 503 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  39.67 
 
 		 449 aa  71.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  39.67 
 
 		 432 aa  71.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.26 
 
 		 954 aa  71.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  40.5 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  40.45 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1058 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  33.33 
 
 		 922 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  39.66 
 
 		 643 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1448 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  39.58 
 
 		 534 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  46.75 
 
 		 1086 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1319 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  41.77 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1217 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.46 
 
 		 913 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1219 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  39.32 
 
 		 1309 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  34.29 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  40.26 
 
 		 1126 aa  61.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  42.25 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  30.36 
 
 		 454 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 756 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  41.67 
 
 		 935 aa  58.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  40.4 
 
 		 309 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.25 
 
 		 974 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  38.18 
 
 		 642 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 630 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1246 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  29.41 
 
 		 456 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  45 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  37.21 
 
 		 1202 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  38.32 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  36.26 
 
 		 1137 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  41.25 
 
 		 582 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  41.05 
 
 		 634 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1081 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  39.76 
 
 		 1200 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  39.8 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  33.8 
 
 		 1198 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 448 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  28.57 
 
 		 363 aa  52  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.68 
 
 		 554 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  35.19 
 
 		 402 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  28.12 
 
 		 545 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  40.24 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  31.71 
 
 		 693 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  36.36 
 
 		 546 aa  48.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  35.04 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  48.53 
 
 		 534 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2221 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  33.64 
 
 		 607 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  39.19 
 
 		 620 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  35.23 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  39.02 
 
 		 464 aa  45.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  32.52 
 
 		 824 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  36.47 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1523 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  33 
 
 		 804 aa  42  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  44.12 
 
 		 799 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1109 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  31.19 
 
 		 577 aa  41.2  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  39.34 
 
 		 595 aa  41.2  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>