30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4350 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4350  hypothetical protein  100 
 
 		 936 aa  1883    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  35.53 
 
 		 723 aa  89.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  38 
 
 		 197 aa  84.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  33.14 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  39.71 
 
 		 896 aa  65.9  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  31.71 
 
 		 239 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  29.51 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  33.68 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  30.49 
 
 		 243 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  38.53 
 
 		 224 aa  55.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  32.59 
 
 		 5185 aa  55.1  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  36.3 
 
 		 909 aa  54.7  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  40 
 
 		 582 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  33.06 
 
 		 1060 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  37.66 
 
 		 569 aa  52.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1448 aa  52.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  36.99 
 
 		 1058 aa  51.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  35.54 
 
 		 2221 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1086 aa  49.7  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  40.54 
 
 		 495 aa  48.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1246 aa  48.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  33.77 
 
 		 968 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1333 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1137 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  36.25 
 
 		 923 aa  46.2  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1403 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  34.21 
 
 		 643 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  33.78 
 
 		 386 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  36.99 
 
 		 184 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  30.33 
 
 		 922 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>