34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4774 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  100 
 
 
634 aa  1301    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  68.12 
 
 
744 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  67.5 
 
 
744 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  54.44 
 
 
448 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  49.36 
 
 
799 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  51.93 
 
 
453 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  63.57 
 
 
306 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  59.02 
 
 
362 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  66.38 
 
 
323 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  52.26 
 
 
368 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.23 
 
 
954 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  35.87 
 
 
1523 aa  67.8  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  34.22 
 
 
1081 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  34.09 
 
 
642 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  36.04 
 
 
643 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  38.3 
 
 
723 aa  58.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  34.46 
 
 
922 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  37.86 
 
 
239 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  31.86 
 
 
1219 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  44.64 
 
 
197 aa  48.1  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  32.96 
 
 
1309 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  28.65 
 
 
569 aa  47.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  36.43 
 
 
258 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  31.58 
 
 
1126 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  37.78 
 
 
620 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  38.81 
 
 
1333 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  30.38 
 
 
968 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  34.48 
 
 
534 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  33.58 
 
 
693 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  33.01 
 
 
243 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  38.89 
 
 
503 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  38.89 
 
 
409 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  28.69 
 
 
1137 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  31.36 
 
 
923 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>