29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2292 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  88.31 
 
 
744 aa  1245    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  100 
 
 
744 aa  1518    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  58.26 
 
 
634 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  28.04 
 
 
804 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  70.37 
 
 
799 aa  158  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  61.96 
 
 
448 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  59.71 
 
 
362 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  60.42 
 
 
453 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  64.8 
 
 
306 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  66.39 
 
 
323 aa  117  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  55.4 
 
 
368 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.14 
 
 
954 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  36.52 
 
 
642 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  36 
 
 
239 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0541  hypothetical protein  37.65 
 
 
423 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0565  hypothetical protein  36.96 
 
 
423 aa  52.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  34.5 
 
 
922 aa  52  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  35.34 
 
 
569 aa  51.2  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  36.05 
 
 
258 aa  51.2  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  31.98 
 
 
1219 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  40.45 
 
 
723 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  32.86 
 
 
1081 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  36.54 
 
 
909 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  34.08 
 
 
896 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  50 
 
 
197 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  36.04 
 
 
620 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.71 
 
 
1126 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  32.98 
 
 
409 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  33.33 
 
 
1058 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>