27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4377 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  100 
 
 
799 aa  1617    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  50.21 
 
 
634 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  57.49 
 
 
453 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  70.37 
 
 
744 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  69.63 
 
 
744 aa  155  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  74.77 
 
 
448 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  55.56 
 
 
362 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  62.4 
 
 
306 aa  127  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  56.71 
 
 
323 aa  121  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  53.94 
 
 
368 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.22 
 
 
954 aa  80.9  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  30.57 
 
 
1137 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  33.47 
 
 
642 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  34.36 
 
 
534 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  29.91 
 
 
1217 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  39.8 
 
 
239 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  43.18 
 
 
723 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  36.54 
 
 
258 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  37.38 
 
 
243 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  31.35 
 
 
235 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  41.38 
 
 
569 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  36.89 
 
 
909 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  34.13 
 
 
1523 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  39.13 
 
 
1448 aa  45.8  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  45.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  36.73 
 
 
409 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>