23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4534 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  53.51 
 
 
634 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  71.43 
 
 
448 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  58.94 
 
 
362 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  69.92 
 
 
744 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  69.11 
 
 
744 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  66.13 
 
 
799 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  57.55 
 
 
453 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  62.28 
 
 
306 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  51.63 
 
 
368 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6291  hypothetical protein  68.75 
 
 
344 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  44 
 
 
954 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  26.67 
 
 
1523 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  36.13 
 
 
239 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  35.71 
 
 
642 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  36.61 
 
 
620 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  35 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  36.13 
 
 
409 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  32.28 
 
 
534 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  34.86 
 
 
432 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  29.95 
 
 
1137 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  29.24 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  28.45 
 
 
1333 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>