29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6291 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6291  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  68.75 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1721  hypothetical protein  50 
 
 		 455 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  51.55 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  40.86 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_003296  RS04804  hypothetical protein  46.53 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  36.79 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  32.33 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  40.2 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  29.77 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  38.14 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  42.45 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  38.64 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1722  hypothetical protein  40.58 
 
 		 381 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  43.14 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  38.54 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  43.14 
 
 		 281 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  34.04 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  37.93 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  46.75 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  38.75 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  39.18 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  39.08 
 
 		 211 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  32.63 
 
 		 191 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  31.31 
 
 		 193 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  33.01 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  44.44 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4287  hypothetical protein  55.17 
 
 		 438 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0458373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  31.11 
 
 		 204 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>