57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1443 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  693    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  39.12 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  39.85 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  35.38 
 
 		 344 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  37.3 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  35.04 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  38.3 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  34.04 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  37.98 
 
 		 211 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  39.02 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  34.02 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  42.14 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  36.91 
 
 		 191 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  36.56 
 
 		 407 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  35.76 
 
 		 232 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  32.18 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  35.96 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  34.69 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  33.81 
 
 		 229 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  29.63 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  35 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  28.9 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  35.57 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  37.33 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  37.75 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  29.7 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  28.73 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  33.54 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1721  hypothetical protein  30.95 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  34.44 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  35.88 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  32.73 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  33.96 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  34.15 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  34.9 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04804  hypothetical protein  32.86 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  35.29 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  29.03 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  29.41 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  28.67 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  32.53 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  31.25 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  29.33 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1250  hypothetical protein  38.54 
 
 		 95 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  28.48 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  29.2 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  26.25 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  31.08 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  30.82 
 
 		 197 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  27.14 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6291  hypothetical protein  34.04 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  34.78 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>