57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6662 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  769    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  34.39 
 
 
384 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  38.73 
 
 
382 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  33.56 
 
 
374 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  32.43 
 
 
372 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  34.78 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  38.81 
 
 
211 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  41.33 
 
 
281 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  41.33 
 
 
281 aa  96.3  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  35.35 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  39.29 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  41.12 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  32.39 
 
 
344 aa  90.5  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  40.61 
 
 
332 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  31.91 
 
 
358 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  36.53 
 
 
326 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  34.27 
 
 
232 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  34.46 
 
 
218 aa  88.2  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  34.71 
 
 
375 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  39.7 
 
 
344 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  33.9 
 
 
229 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04804  hypothetical protein  33.75 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  33.49 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  33.7 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  31.28 
 
 
231 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  34.68 
 
 
247 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  33.53 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  35.48 
 
 
208 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  29.83 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  31.61 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  31.76 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  45.05 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  30.11 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1721  hypothetical protein  38.46 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  36.13 
 
 
191 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  32.93 
 
 
245 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  30.99 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  30.17 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  31.9 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  33.11 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  39.58 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  32.18 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  29.52 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  31.74 
 
 
244 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  30.36 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  34.13 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  30.81 
 
 
240 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  30.34 
 
 
261 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  30.97 
 
 
244 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  26.18 
 
 
193 aa  62.8  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  26.84 
 
 
197 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6291  hypothetical protein  38.64 
 
 
344 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  26.02 
 
 
414 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1250  hypothetical protein  34.07 
 
 
95 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  27 
 
 
407 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  42.11 
 
 
436 aa  49.7  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  26.38 
 
 
266 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>