55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1770 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  493  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  74.11 
 
 
244 aa  350  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  75.6 
 
 
244 aa  335  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  76 
 
 
243 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  70.7 
 
 
244 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  69.44 
 
 
245 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  72.04 
 
 
244 aa  317  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  71.9 
 
 
245 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  63.94 
 
 
247 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  57.73 
 
 
232 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  57.53 
 
 
231 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  56.96 
 
 
240 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  55.56 
 
 
235 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  56.33 
 
 
231 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  58.74 
 
 
235 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  56.87 
 
 
231 aa  255  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  55.8 
 
 
232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  53.07 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  53.12 
 
 
232 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  57.69 
 
 
218 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  57.28 
 
 
229 aa  238  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  50.27 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  42.25 
 
 
261 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  38.05 
 
 
266 aa  142  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  85.5  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  36.92 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  33.72 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  28.04 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  28.4 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  28.4 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  31.65 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  31.03 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  34.59 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  33.96 
 
 
390 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  30.43 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  30.66 
 
 
344 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  29.17 
 
 
326 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  25.65 
 
 
382 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  26.42 
 
 
328 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  32.26 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  33.33 
 
 
384 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  31.28 
 
 
191 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  30.88 
 
 
358 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  30.61 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  30.26 
 
 
393 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  27.14 
 
 
344 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  32.52 
 
 
374 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  30.57 
 
 
372 aa  52.4  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  29.11 
 
 
414 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  26.71 
 
 
392 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  32.64 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  28.78 
 
 
407 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04804  hypothetical protein  24.02 
 
 
416 aa  43.5  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1250  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  42.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  38.78 
 
 
436 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>