52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3056 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  814    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  33.82 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  36.56 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  33.67 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  29.95 
 
 		 281 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  38.03 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  29.95 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  34.25 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  33.7 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  26.32 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  32.79 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  30.73 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  31.63 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  38.56 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  30.81 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  37.09 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  32.84 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  30.72 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  32.62 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  28.72 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  26.45 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  30.83 
 
 		 245 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  32.84 
 
 		 245 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  29.85 
 
 		 232 aa  53.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  32.45 
 
 		 232 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  30.14 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  30.88 
 
 		 240 aa  51.2  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  26.8 
 
 		 261 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  36.91 
 
 		 193 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  30.87 
 
 		 229 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  29.84 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  30.83 
 
 		 231 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  30.25 
 
 		 244 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  35.29 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1250  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  28.78 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1721  hypothetical protein  34.23 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  30.37 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  30.5 
 
 		 244 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  27.54 
 
 		 247 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  30.22 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  26.67 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  30.5 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  28.09 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  28.87 
 
 		 243 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  26.8 
 
 		 231 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  35.62 
 
 		 436 aa  43.1  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>