55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3559 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  97.13 
 
 		 229 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  86.7 
 
 		 232 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  85.31 
 
 		 231 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  83.11 
 
 		 231 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  73.49 
 
 		 232 aa  319  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  68.08 
 
 		 231 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  70.48 
 
 		 235 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  71.56 
 
 		 232 aa  304  6e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  68.84 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  65.87 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  64.65 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  62.56 
 
 		 240 aa  262  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  58.96 
 
 		 244 aa  261  4e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  58.85 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  60.77 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  57.89 
 
 		 244 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  55.92 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  57.69 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  59 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  53.33 
 
 		 244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  51.09 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  42.79 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  40 
 
 		 367 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  35.62 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  32.56 
 
 		 281 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  32.56 
 
 		 281 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  35.46 
 
 		 332 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  39.42 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  37.68 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  32.42 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  33.55 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  31.79 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  35 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  35.92 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  36.31 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  33.55 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  35.14 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  32.89 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  30.86 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  33.9 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  35.04 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  32.42 
 
 		 382 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  31.43 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  32.81 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  30.96 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  26.6 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  35.37 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1721  hypothetical protein  30 
 
 		 455 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  30.14 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  29.58 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  30 
 
 		 407 aa  48.5  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04804  hypothetical protein  26.7 
 
 		 416 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>