53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3966 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  487  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  71.07 
 
 
244 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  72.32 
 
 
245 aa  334  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  78.16 
 
 
244 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  79.6 
 
 
243 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  72.56 
 
 
244 aa  322  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  72.04 
 
 
246 aa  317  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  74.52 
 
 
245 aa  315  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  66.81 
 
 
247 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  62.16 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  58.12 
 
 
235 aa  277  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  58.52 
 
 
235 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  60.19 
 
 
240 aa  271  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  58.97 
 
 
232 aa  271  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  59.72 
 
 
232 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  60.68 
 
 
231 aa  263  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  59.71 
 
 
231 aa  260  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  60.1 
 
 
232 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  57.89 
 
 
218 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  55.87 
 
 
232 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  58.42 
 
 
229 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  46.08 
 
 
263 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  41.71 
 
 
261 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  41.47 
 
 
266 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  34.56 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  30.57 
 
 
281 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  29.52 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  32.93 
 
 
367 aa  78.6  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  33.53 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  35.37 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  32.62 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  28.12 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  34.72 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  32.12 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  34.58 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  29.14 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  32.21 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  30 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  29.61 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  33.09 
 
 
326 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  35.45 
 
 
390 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  28.03 
 
 
328 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  29.49 
 
 
208 aa  62  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  32.58 
 
 
382 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  30.06 
 
 
365 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  31.33 
 
 
193 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  26.51 
 
 
414 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  29.8 
 
 
393 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  26.83 
 
 
436 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  30.13 
 
 
372 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  32.62 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  30.25 
 
 
407 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  29.33 
 
 
392 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>