57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1451 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1451  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  753    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.520035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1961  hypothetical protein  50.26 
 
 		 382 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2791  hypothetical protein  42.9 
 
 		 372 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1299  hypothetical protein  38.76 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01566  hypothetical protein  34.65 
 
 		 365 aa  188  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.264184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1444  hypothetical protein  40.16 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0952754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2537  hypothetical protein  32.87 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.42829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2026  hypothetical protein  35.93 
 
 		 281 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0228946  normal  0.291576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1950  hypothetical protein  35.93 
 
 		 281 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000488378  normal  0.190979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3303  hypothetical protein  41.62 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6662  hypothetical protein  34.89 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.633084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1542  hypothetical protein  44.38 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.421236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0120  hypothetical protein  41.33 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6125  hypothetical protein  40.72 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.226395  normal  0.500554 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1443  hypothetical protein  39.63 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1468  hypothetical protein  44.1 
 
 		 211 aa  106  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00584135  normal  0.0667336 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5109  hypothetical protein  38.07 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2122  hypothetical protein  39.88 
 
 		 332 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0876897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1291  hypothetical protein  32.3 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0185719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1721  hypothetical protein  30.79 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2565  putative transmembrane protein  34.66 
 
 		 392 aa  89.7  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1250  hypothetical protein  50.54 
 
 		 95 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5081  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.465912 
 
 
-
 
NC_003296  RS04804  hypothetical protein  30.83 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2521  hypothetical protein  35.19 
 
 		 232 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4383  hypothetical protein  32.93 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843651  normal  0.212711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1348  hypothetical protein  32.81 
 
 		 232 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3994  hypothetical protein  31.74 
 
 		 231 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3468  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1928  hypothetical protein  31.84 
 
 		 235 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3559  hypothetical protein  36.31 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31000  hypothetical protein  37.42 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425681  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00304  hypothetical protein  32.5 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.960293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2506  hypothetical protein  36.13 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113634  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2670  hypothetical protein  30.73 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.74743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  35.03 
 
 		 229 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4862  hypothetical protein  33.75 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1879  hypothetical protein  35.29 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5138  hypothetical protein  32.39 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187307  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1806  hypothetical protein  31.14 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4235  hypothetical protein  34.55 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000309051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0273  hypothetical protein  30.26 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2938  hypothetical protein  29.61 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5164  hypothetical protein  29.94 
 
 		 245 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  31.08 
 
 		 244 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2240  hypothetical protein  31.17 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00222904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04010  hypothetical protein  29.22 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6291  hypothetical protein  40.86 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  29.94 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3056  hypothetical protein  29.23 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  29.44 
 
 		 244 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1770  hypothetical protein  30.97 
 
 		 246 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0635916 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5614  hypothetical protein  31.29 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2099  hypothetical protein  25.44 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2769  hypothetical protein  40.4 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0531  hypothetical protein  25.17 
 
 		 197 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.826605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>