18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0710 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  737    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  58.6 
 
 
362 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1808  hypothetical protein  48.48 
 
 
225 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2781  hypothetical protein  39.39 
 
 
233 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0602244  hitchhiker  0.000135479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  52.26 
 
 
634 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  51.63 
 
 
448 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  60.32 
 
 
799 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  59.5 
 
 
744 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  58.68 
 
 
744 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  53.91 
 
 
453 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  55.26 
 
 
306 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  55.86 
 
 
323 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.52 
 
 
954 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  32.97 
 
 
1448 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  39.33 
 
 
620 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  39.02 
 
 
642 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  42.2 
 
 
1081 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  34.55 
 
 
184 aa  42.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>