17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1807 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  724    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  58.6 
 
 
368 aa  358  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1808  hypothetical protein  55.56 
 
 
225 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2781  hypothetical protein  43.05 
 
 
233 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0602244  hitchhiker  0.000135479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  59.02 
 
 
634 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  59.71 
 
 
744 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  61.32 
 
 
448 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  57.55 
 
 
744 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  55.47 
 
 
799 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  50.35 
 
 
453 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  67.29 
 
 
323 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  53.85 
 
 
306 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  39.52 
 
 
954 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  33.33 
 
 
1448 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  39.56 
 
 
620 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  39.51 
 
 
642 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  33.7 
 
 
184 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>