28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1990 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  610  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7133  normal  0.438059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  56.97 
 
 		 634 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  65.09 
 
 		 448 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  66.95 
 
 		 744 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  66.1 
 
 		 744 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4377  hypothetical protein  64.1 
 
 		 799 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1807  hypothetical protein  53.85 
 
 		 362 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.131489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  56.03 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4534  hypothetical protein  62.62 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.737343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0710  hypothetical protein  44.94 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.39 
 
 		 954 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  39.45 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  38.67 
 
 		 723 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  51.79 
 
 		 197 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  37.82 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  34.75 
 
 		 909 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  35.34 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  33.57 
 
 		 620 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  41.79 
 
 		 923 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  31.68 
 
 		 503 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  33.33 
 
 		 968 aa  46.6  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  40.98 
 
 		 1403 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  38.82 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  35.35 
 
 		 386 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1126 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  39.22 
 
 		 693 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  36.67 
 
 		 409 aa  42.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>