14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0733 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  100 
 
 
1523 aa  3024    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.1 
 
 
954 aa  87  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  35.87 
 
 
634 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  29.55 
 
 
643 aa  55.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  32.11 
 
 
922 aa  55.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  31.17 
 
 
1219 aa  52.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  32.35 
 
 
1309 aa  52.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  32.26 
 
 
1137 aa  52  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4266  17 kDa surface antigen  30.67 
 
 
448 aa  51.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.123059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  36.3 
 
 
896 aa  50.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.84 
 
 
913 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5399  hypothetical protein  28.24 
 
 
453 aa  48.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000193647  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  33.62 
 
 
239 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  32.78 
 
 
243 aa  47  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>