36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2036 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  100 
 
 
804 aa  1631    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2294  hypothetical protein  28.16 
 
 
744 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2292  hypothetical protein  28.31 
 
 
744 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.32606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  70.1 
 
 
824 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  72.16 
 
 
402 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  68.63 
 
 
201 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  57.38 
 
 
607 aa  149  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  75.27 
 
 
464 aa  145  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  67 
 
 
192 aa  140  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  65.31 
 
 
454 aa  138  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  59.43 
 
 
577 aa  134  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  49.3 
 
 
546 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  61.22 
 
 
545 aa  131  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  43.3 
 
 
643 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.37 
 
 
913 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  55.45 
 
 
161 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  45.45 
 
 
922 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  44 
 
 
1309 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  42.86 
 
 
1219 aa  98.6  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  49.06 
 
 
234 aa  97.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  45.08 
 
 
534 aa  92  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  38.29 
 
 
1217 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  37.86 
 
 
1137 aa  77.4  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  44.34 
 
 
935 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  39.37 
 
 
235 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  34.78 
 
 
642 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0565  hypothetical protein  35.56 
 
 
423 aa  51.2  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0826  hypothetical protein  41.67 
 
 
437 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.108201  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0541  hypothetical protein  35.56 
 
 
423 aa  50.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  36.76 
 
 
1081 aa  47.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1411  hypothetical protein  25.29 
 
 
418 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  31.86 
 
 
723 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4774  hypothetical protein  29.41 
 
 
634 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.1009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  32.61 
 
 
409 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1573  hypothetical protein  25 
 
 
383 aa  45.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0733  hypothetical protein  26.58 
 
 
1523 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26335  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>