33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3918 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  403  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  50.28 
 
 		 464 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  45.56 
 
 		 824 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  45.9 
 
 		 402 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  70.1 
 
 		 804 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  49.04 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  64.42 
 
 		 607 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  52.42 
 
 		 454 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  52.1 
 
 		 546 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  60.2 
 
 		 545 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  58.82 
 
 		 577 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  40.4 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  52.48 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  50.94 
 
 		 922 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1309 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  47.17 
 
 		 935 aa  85.1  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  47.62 
 
 		 643 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  49.52 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  50 
 
 		 1219 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  45.71 
 
 		 1217 aa  82.8  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  51.09 
 
 		 913 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  41.35 
 
 		 1137 aa  76.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  43.3 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  39.8 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  37.18 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  32.98 
 
 		 723 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  34.29 
 
 		 909 aa  45.1  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  33.63 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  31.03 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  38.3 
 
 		 409 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1086 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  42  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>