83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1862 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  100 
 
 
1086 aa  2133    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.44 
 
 
1126 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4244  hypothetical protein  25.43 
 
 
1117 aa  112  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  40.11 
 
 
1403 aa  109  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  40.35 
 
 
756 aa  95.1  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  27.48 
 
 
1333 aa  94.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  40.45 
 
 
405 aa  91.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  36.67 
 
 
1448 aa  90.1  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  49.44 
 
 
495 aa  86.7  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  39.5 
 
 
1319 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  50.56 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  52.38 
 
 
224 aa  85.9  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  44.09 
 
 
1200 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.14 
 
 
974 aa  84  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  45.54 
 
 
222 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0992  hypothetical protein  27.78 
 
 
980 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.44 
 
 
630 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  50.56 
 
 
274 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  45.88 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  43.18 
 
 
280 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  33.09 
 
 
1246 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  41.73 
 
 
1058 aa  79  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  43.36 
 
 
909 aa  79  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  51.16 
 
 
184 aa  78.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  47.73 
 
 
242 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  47.62 
 
 
923 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  46.81 
 
 
1202 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  46.84 
 
 
1137 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  40 
 
 
896 aa  76.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  41.22 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.05 
 
 
554 aa  75.1  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  41.67 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  42.86 
 
 
693 aa  74.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  44.68 
 
 
466 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  40.48 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  44.3 
 
 
239 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  45.45 
 
 
235 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  72.4  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  48.1 
 
 
243 aa  72.4  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  49.35 
 
 
643 aa  71.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  45.98 
 
 
922 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  44.12 
 
 
1219 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  46.43 
 
 
582 aa  69.7  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  46.84 
 
 
620 aa  69.7  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  45.45 
 
 
968 aa  68.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  45.12 
 
 
935 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  40 
 
 
1217 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  41.38 
 
 
449 aa  66.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  45.45 
 
 
723 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  43.22 
 
 
432 aa  65.1  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  46.75 
 
 
197 aa  63.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  40.51 
 
 
258 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  41.89 
 
 
1309 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  48.05 
 
 
2221 aa  62  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  46.84 
 
 
238 aa  61.6  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  40.82 
 
 
1545 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.14 
 
 
913 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  40.4 
 
 
1420 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  37.61 
 
 
642 aa  60.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  41.56 
 
 
569 aa  60.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  52 
 
 
313 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  29.41 
 
 
1060 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  40.74 
 
 
639 aa  58.9  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  41.56 
 
 
409 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  39.39 
 
 
1503 aa  57.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  48.65 
 
 
1627 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  39.39 
 
 
1637 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  43.75 
 
 
1081 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  40.4 
 
 
486 aa  56.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  46.15 
 
 
595 aa  56.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  41.89 
 
 
3036 aa  56.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  40 
 
 
866 aa  56.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  48.05 
 
 
1198 aa  55.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1661  hypothetical protein  46.25 
 
 
974 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.254105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  38.18 
 
 
161 aa  50.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4350  hypothetical protein  40.54 
 
 
936 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  37.35 
 
 
577 aa  49.7  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  33.77 
 
 
456 aa  50.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  41.03 
 
 
1109 aa  48.5  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  28.81 
 
 
546 aa  48.1  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.03 
 
 
954 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  32.47 
 
 
363 aa  48.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  46.88 
 
 
632 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>