70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1562 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  100 
 
 		 545 aa  1122    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0636  bifunctional autolysin  44.03 
 
 		 1335 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000166594  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1862  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.92 
 
 		 284 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1135  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.03 
 
 		 1248 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00817868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1827  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.92 
 
 		 284 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1112  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase., mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  44.03 
 
 		 1248 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00229916  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1330  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.7 
 
 		 283 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0937897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  44.53 
 
 		 577 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  48.15 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  70.8 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2373  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  40.72 
 
 		 258 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.628854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2330  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  40.72 
 
 		 258 aa  155  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1891  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.58 
 
 		 258 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0363  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.81 
 
 		 624 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0372  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.81 
 
 		 624 aa  146  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0909  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  38.57 
 
 		 632 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0927  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  38.57 
 
 		 632 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1245  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  34.65 
 
 		 969 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0232944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1439  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  35.18 
 
 		 1049 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00896108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  54.01 
 
 		 824 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  49.61 
 
 		 201 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  60.91 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  46.1 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  59.13 
 
 		 607 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  61.29 
 
 		 804 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  56.12 
 
 		 192 aa  111  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  36.31 
 
 		 643 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  47.42 
 
 		 161 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  43.52 
 
 		 534 aa  87.4  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  43.93 
 
 		 1309 aa  87  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.96 
 
 		 913 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  42.74 
 
 		 935 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  35.5 
 
 		 1219 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  44.04 
 
 		 922 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  37.59 
 
 		 1217 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  36.3 
 
 		 1137 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  27.92 
 
 		 1281 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1863  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  29.19 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27744e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1818  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.19 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000545238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1683  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.19 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00306779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  40.21 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1629  S-layer protein  30.77 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00040233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  26.49 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.32 
 
 		 843 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  28.66 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1890  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.48 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00294488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  28.57 
 
 		 723 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1939  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 4  29.41 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000781755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1431  S-layer domain-containing protein  28.03 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  28.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  38.96 
 
 		 222 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  33.63 
 
 		 224 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0048  TraG  28.67 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000012382  normal  0.663313 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  26.37 
 
 		 866 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1126 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  34.88 
 
 		 184 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  28.87 
 
 		 627 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  32.76 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3796  hypothetical protein  25.94 
 
 		 855 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  37.5 
 
 		 274 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1058 aa  45.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  30.19 
 
 		 456 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0787  mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosamidase  35.29 
 
 		 234 aa  44.7  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1109 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.47 
 
 		 974 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  27.78 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1086 aa  44.3  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  39.13 
 
 		 1343 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>