12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1492 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  100 
 
 
1343 aa  2682    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  35.16 
 
 
1333 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1494  hypothetical protein  96.2 
 
 
296 aa  269  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  25.68 
 
 
1393 aa  160  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  28.3 
 
 
1090 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  27.62 
 
 
1545 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  27.33 
 
 
1420 aa  98.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  22.48 
 
 
1442 aa  94.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  29.31 
 
 
755 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  28.17 
 
 
1503 aa  82  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  28.17 
 
 
1637 aa  81.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  32 
 
 
454 aa  45.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>