12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4530 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  79.42 
 
 
1090 aa  1213    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  100 
 
 
1393 aa  2774    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  27.02 
 
 
1333 aa  308  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  25.21 
 
 
1343 aa  151  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  32.96 
 
 
1545 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  32.96 
 
 
1420 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0656  hypothetical protein  29.78 
 
 
598 aa  126  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.993667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  34.33 
 
 
755 aa  118  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  36.05 
 
 
1503 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  36.05 
 
 
1637 aa  115  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  32.53 
 
 
1442 aa  92.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  22.83 
 
 
3036 aa  50.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>