16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2400 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  100 
 
 
1333 aa  2680    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0656  hypothetical protein  56.72 
 
 
598 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.993667  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  38.91 
 
 
1343 aa  323  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  28.91 
 
 
1393 aa  308  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  27.71 
 
 
1090 aa  294  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  30.45 
 
 
1545 aa  116  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  28.69 
 
 
1420 aa  111  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  31.44 
 
 
755 aa  109  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  31.6 
 
 
1503 aa  102  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  31.6 
 
 
1637 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  29.08 
 
 
1442 aa  94.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  53.85 
 
 
546 aa  66.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  40.96 
 
 
577 aa  63.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2668  hypothetical protein  70.21 
 
 
78 aa  59.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.33 
 
 
1586 aa  49.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2136  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  47  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000717583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>