17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3888 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  97.48 
 
 		 1503 aa  775    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3888  hypothetical protein  100 
 
 		 755 aa  1488    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0375418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  74.95 
 
 		 1545 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  75.21 
 
 		 1420 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  97.48 
 
 		 1637 aa  776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4530  hypothetical protein  35.15 
 
 		 1393 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1333 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2918  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1090 aa  107  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1498  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1442 aa  97.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.469243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0797  hypothetical protein  63.33 
 
 		 241 aa  87.8  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1343 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  24.25 
 
 		 3036 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5552  hypothetical protein  43.75 
 
 		 229 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf647  massive surface protein MspG  23.56 
 
 		 2711 aa  48.5  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf057  massive surface protein MspA  24.88 
 
 		 2336 aa  48.5  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf481  massive surface protein MspD  24.46 
 
 		 2592 aa  46.2  0.002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0338374  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5849  hypothetical protein  23.9 
 
 		 786 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>