31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3796 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 855 aa  1724    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.929289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  75.03 
 
 		 866 aa  1208    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  37.74 
 
 		 935 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1137 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  40 
 
 		 1219 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  41.33 
 
 		 922 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1309 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  34.71 
 
 		 1217 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  36.36 
 
 		 405 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  35.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1246 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.77 
 
 		 913 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  35.53 
 
 		 235 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1333 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  30.38 
 
 		 503 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  46.81 
 
 		 534 aa  48.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  38.81 
 
 		 643 aa  48.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  38.81 
 
 		 534 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1195  hypothetical protein  36.94 
 
 		 1627 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.62343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4556  PhcA  30.53 
 
 		 559 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  35.29 
 
 		 486 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  34.26 
 
 		 3036 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1545 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  37.68 
 
 		 1109 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1086 aa  46.2  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  37.78 
 
 		 620 aa  45.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1420 aa  45.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 630 aa  45.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  37.5 
 
 		 693 aa  45.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  25.94 
 
 		 545 aa  44.3  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>