33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3838 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  945    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  59.56 
 
 		 824 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  51.38 
 
 		 201 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  60.16 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  56.2 
 
 		 607 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  75.27 
 
 		 804 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  45.88 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  50.3 
 
 		 192 aa  139  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  60.71 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  57.94 
 
 		 577 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  46.1 
 
 		 545 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  39.09 
 
 		 234 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  56.7 
 
 		 161 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  54.81 
 
 		 643 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  43.31 
 
 		 534 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  54 
 
 		 913 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  50.48 
 
 		 1309 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1217 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  43.7 
 
 		 922 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1219 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1137 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  46.23 
 
 		 935 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  48.6 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  35.85 
 
 		 239 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  39.02 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  31.9 
 
 		 896 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  40.54 
 
 		 1086 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  36.05 
 
 		 409 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  34.86 
 
 		 642 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1126 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  31.15 
 
 		 258 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  26.76 
 
 		 309 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>