44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3618 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  35.33 
 
 
1403 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  31.25 
 
 
1319 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  36.43 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  39.76 
 
 
243 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  40.74 
 
 
1060 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  39.76 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  35.48 
 
 
503 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  37.5 
 
 
569 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1661  hypothetical protein  34.35 
 
 
974 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.254105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  39.51 
 
 
923 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  36.73 
 
 
495 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  35.96 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  40.96 
 
 
309 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.21 
 
 
630 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  39.76 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  37.61 
 
 
1109 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  37.8 
 
 
896 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 
756 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.76 
 
 
974 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  42.55 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  35.24 
 
 
1058 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  36.96 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  35.23 
 
 
258 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  27.21 
 
 
1126 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  39.76 
 
 
184 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  39.74 
 
 
693 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  34.04 
 
 
639 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  32.85 
 
 
449 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  37.66 
 
 
313 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  32.93 
 
 
909 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  35.14 
 
 
935 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  32.98 
 
 
582 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  31.25 
 
 
386 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  34.12 
 
 
968 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  35 
 
 
432 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  37.8 
 
 
723 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  37.93 
 
 
922 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  36.47 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  35.14 
 
 
1086 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  36.75 
 
 
1219 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  30.11 
 
 
405 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.58 
 
 
554 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  26.85 
 
 
1333 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>