14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1661 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1661  hypothetical protein  100 
 
 		 974 aa  1807    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2819  hypothetical protein  68.03 
 
 		 872 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1319 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  38.64 
 
 		 503 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  46.67 
 
 		 224 aa  55.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  40.45 
 
 		 495 aa  51.6  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  46.25 
 
 		 1086 aa  50.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 534 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1403 aa  48.5  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1202 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1448 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  35.85 
 
 		 184 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  39.08 
 
 		 222 aa  45.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  41.43 
 
 		 582 aa  44.7  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>