20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2819 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2819  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1609    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1661  hypothetical protein  68.03 
 
 		 974 aa  435  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254105 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  39.81 
 
 		 1060 aa  61.6  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1319 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  40.58 
 
 		 503 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1202 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  46.97 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  44.59 
 
 		 1403 aa  52.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  40.43 
 
 		 222 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  42.86 
 
 		 495 aa  50.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  44.12 
 
 		 184 aa  48.5  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1086 aa  48.5  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 534 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  44.93 
 
 		 274 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 723 aa  45.8  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1200 aa  45.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 974 aa  44.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  35.4 
 
 		 582 aa  44.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  38.67 
 
 		 1448 aa  45.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  34.12 
 
 		 923 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>