73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1671 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 1202 aa  2425    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  87.09 
 
 		 1200 aa  2081    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  40.59 
 
 		 1319 aa  566  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0992  hypothetical protein  41.37 
 
 		 980 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  34.98 
 
 		 280 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1246 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  34.5 
 
 		 309 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  34.96 
 
 		 274 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1126 aa  99.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  31.23 
 
 		 503 aa  97.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  33.94 
 
 		 386 aa  96.3  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  51.28 
 
 		 1448 aa  94.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  41.04 
 
 		 1058 aa  91.7  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.04 
 
 		 554 aa  89.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1333 aa  89  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 		 630 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  36.07 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.26 
 
 		 974 aa  85.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  31.31 
 
 		 242 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4244  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1117 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  35.33 
 
 		 239 aa  82.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  44.3 
 
 		 1060 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  35.06 
 
 		 923 aa  77.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  31.11 
 
 		 756 aa  77.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  46.81 
 
 		 1086 aa  76.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  35.26 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1403 aa  74.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  38.05 
 
 		 693 aa  72.4  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  40.48 
 
 		 258 aa  72.4  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  42.53 
 
 		 235 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  39.83 
 
 		 922 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  43.75 
 
 		 224 aa  69.3  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  42.5 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  43.96 
 
 		 1219 aa  68.2  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1198 aa  68.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  35.56 
 
 		 909 aa  68.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  30.47 
 
 		 968 aa  67.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  38 
 
 		 1137 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  45.24 
 
 		 238 aa  65.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  32.14 
 
 		 896 aa  65.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  44.16 
 
 		 2221 aa  65.1  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  46.77 
 
 		 620 aa  64.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  42.47 
 
 		 243 aa  63.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1217 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  39.08 
 
 		 935 aa  62  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  41.86 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  33.57 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  37.5 
 
 		 639 aa  61.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1109 aa  59.7  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1545 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  33.77 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  44.59 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  42.47 
 
 		 3036 aa  58.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  37.3 
 
 		 197 aa  56.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.08 
 
 		 913 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  41.67 
 
 		 643 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  36.75 
 
 		 723 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  32.47 
 
 		 456 aa  56.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1420 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  43.84 
 
 		 313 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1309 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  39.78 
 
 		 184 aa  54.3  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  42.19 
 
 		 595 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  39.51 
 
 		 432 aa  53.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  39.51 
 
 		 449 aa  52.4  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 534 aa  52  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  35.37 
 
 		 486 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1503 aa  51.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  32.65 
 
 		 632 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  34.44 
 
 		 1637 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1081 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 974 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>