81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2549 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1011    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  38.57 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  37.04 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  37.84 
 
 		 309 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1333 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  36.26 
 
 		 1246 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  50.88 
 
 		 242 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  52.73 
 
 		 274 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  35.51 
 
 		 1403 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  30.65 
 
 		 503 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.46 
 
 		 630 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  37.18 
 
 		 756 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.43 
 
 		 974 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1126 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1202 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  46 
 
 		 239 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  33.86 
 
 		 968 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  50 
 
 		 1058 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  48.67 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  55 
 
 		 258 aa  91.3  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1200 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1319 aa  90.1  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  48.67 
 
 		 432 aa  90.1  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  47.57 
 
 		 569 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  54.95 
 
 		 238 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  44.32 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  39.18 
 
 		 234 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  42.97 
 
 		 1448 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  49.44 
 
 		 1086 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  48.15 
 
 		 184 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  51.25 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  36.43 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1060 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  39.29 
 
 		 923 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  44.83 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  47.25 
 
 		 224 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  28.04 
 
 		 363 aa  79  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  45.45 
 
 		 909 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  28.04 
 
 		 456 aa  78.2  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  40.74 
 
 		 693 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  46.32 
 
 		 723 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  54.84 
 
 		 620 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  53.85 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  40.32 
 
 		 896 aa  73.2  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  47.87 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  48.05 
 
 		 643 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  43.43 
 
 		 1137 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  41.86 
 
 		 534 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  44.09 
 
 		 1198 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  41.11 
 
 		 639 aa  70.1  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  47.89 
 
 		 935 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  50.79 
 
 		 1219 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  50.79 
 
 		 913 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  48.48 
 
 		 1217 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  49.21 
 
 		 922 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  46.07 
 
 		 1081 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  48.48 
 
 		 1309 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  36.57 
 
 		 2221 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  45.45 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  45.57 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  44.87 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  41 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2638  hypothetical protein  43.04 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.950991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  41.1 
 
 		 595 aa  60.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  46.58 
 
 		 1545 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1000  hypothetical protein  46.58 
 
 		 1420 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00761303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3618  hypothetical protein  38.78 
 
 		 222 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  hitchhiker  0.000427354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1661  hypothetical protein  40.45 
 
 		 974 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  40 
 
 		 3036 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.85 
 
 		 954 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0926  hypothetical protein  37.86 
 
 		 108 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0424776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  42.67 
 
 		 486 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  46.03 
 
 		 1503 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  46.03 
 
 		 1637 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  43.28 
 
 		 632 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4350  hypothetical protein  40.54 
 
 		 936 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  37.04 
 
 		 1109 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1085  hypothetical protein  38.16 
 
 		 866 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  33.78 
 
 		 577 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  35.14 
 
 		 545 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>