256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1863 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1863  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
756 aa  1523    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.397529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2523  hypothetical protein  36.95 
 
 
386 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2828  hypothetical protein  36.76 
 
 
309 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2819  hypothetical protein  34.42 
 
 
280 aa  104  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0833811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1653  hypothetical protein  40.5 
 
 
274 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5241  hypothetical protein  32.43 
 
 
1319 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000238802  unclonable  0.00000000000023069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2548  hypothetical protein  37.04 
 
 
1403 aa  99.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.300555  normal  0.511808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1146  response regulator receiver domain-containing protein  34.27 
 
 
242 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.480298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  37.18 
 
 
495 aa  95.5  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.57 
 
 
974 aa  94.4  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0663  hypothetical protein  30.49 
 
 
1126 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00858372  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  52.87 
 
 
222 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1876  hypothetical protein  34.9 
 
 
968 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  52.75 
 
 
224 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2827  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.26 
 
 
630 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.789654  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1858  hypothetical protein  35.42 
 
 
569 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5238  hypothetical protein  46.51 
 
 
503 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0161001  hitchhiker  0.000000000167014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5392  hypothetical protein  50.63 
 
 
243 aa  83.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1742  hypothetical protein  33.63 
 
 
1448 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.416454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3166  hypothetical protein  42.53 
 
 
1333 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.0000161537  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  41.94 
 
 
405 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2557  hypothetical protein  32.6 
 
 
1200 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3601  hypothetical protein  46.81 
 
 
1058 aa  81.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000186379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1896  hypothetical protein  38.24 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163345  normal  0.0496265 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1671  hypothetical protein  31.11 
 
 
1202 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0933  hypothetical protein  46.84 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3521  hypothetical protein  45.74 
 
 
693 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399321  normal  0.178114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2649  hypothetical protein  59.42 
 
 
620 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0121345  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.57 
 
 
554 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0752  hypothetical protein  39.53 
 
 
432 aa  76.6  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.647473  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0825  hypothetical protein  46.43 
 
 
909 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.944822  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1497  hypothetical protein  53.25 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0630351  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0748  hypothetical protein  39.53 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.158641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1190  hypothetical protein  49.37 
 
 
639 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  35.6 
 
 
1086 aa  73.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  48.15 
 
 
1137 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1142  hypothetical protein  32.83 
 
 
923 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.66569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  45.57 
 
 
235 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2259  hypothetical protein  49.37 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.135738  hitchhiker  0.00169475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3055  OmpA/MotB domain-containing protein  47.67 
 
 
534 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611511 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0754  hypothetical protein  39.32 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0857  hypothetical protein  32.63 
 
 
1060 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  35.87 
 
 
643 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3059  hypothetical protein  46.15 
 
 
1081 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.893943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  33.09 
 
 
1246 aa  67.8  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0746  hypothetical protein  38.33 
 
 
363 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413253  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  45.07 
 
 
234 aa  65.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1821  hypothetical protein  45.12 
 
 
2221 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
227 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1026  hypothetical protein  43.53 
 
 
582 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2469  hypothetical protein  43.42 
 
 
595 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148862  decreased coverage  0.00336979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  45.83 
 
 
1217 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  38.75 
 
 
534 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  45.71 
 
 
935 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  43.06 
 
 
1309 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  33.33 
 
 
248 aa  62.4  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1878  OmpA/MotB  43.21 
 
 
466 aa  60.1  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0826  hypothetical protein  45.35 
 
 
896 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337826  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  42.86 
 
 
913 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  36.19 
 
 
355 aa  59.7  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  31.53 
 
 
294 aa  58.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  42.86 
 
 
197 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  47.44 
 
 
632 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  38.18 
 
 
402 aa  57.8  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1887  hypothetical protein  40.91 
 
 
184 aa  57.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00443478  normal  0.0909013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5546  hypothetical protein  42.39 
 
 
1503 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.21489  normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2115  hypothetical protein  44.87 
 
 
1637 aa  57.4  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332522  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0865  hypothetical protein  39.77 
 
 
1198 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.291273  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  39.24 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3887  hypothetical protein  42.67 
 
 
486 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  44.16 
 
 
723 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  37.97 
 
 
922 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 
324 aa  55.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
433 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 
239 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  32.43 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.84 
 
 
266 aa  53.5  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  29.93 
 
 
240 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0659  outer membrane protein, OmpA family  41.43 
 
 
307 aa  53.9  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  39.47 
 
 
321 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  34.35 
 
 
232 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.91 
 
 
509 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 
242 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  34.23 
 
 
219 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  30.09 
 
 
217 aa  53.5  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  35.42 
 
 
340 aa  53.5  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0981  hypothetical protein  42.47 
 
 
1545 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  33.93 
 
 
226 aa  53.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  30.09 
 
 
217 aa  53.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 
239 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 
229 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.41 
 
 
367 aa  53.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 
264 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  24.73 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
237 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
218 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0795  hypothetical protein  41.43 
 
 
1109 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
218 aa  52.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>