50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1357 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1565    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  57.41 
 
 		 848 aa  611  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  27.82 
 
 		 704 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  29.29 
 
 		 740 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  29.92 
 
 		 762 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  28.76 
 
 		 719 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  23.58 
 
 		 848 aa  101  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  27.27 
 
 		 769 aa  98.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  25.2 
 
 		 907 aa  97.4  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  25.15 
 
 		 799 aa  97.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  27.17 
 
 		 846 aa  94  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  24.64 
 
 		 857 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  25.54 
 
 		 835 aa  93.2  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  24.84 
 
 		 787 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  25.29 
 
 		 871 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  25.66 
 
 		 874 aa  91.3  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  25.4 
 
 		 842 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  23.84 
 
 		 904 aa  89  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  24.68 
 
 		 856 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  24.61 
 
 		 856 aa  88.6  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  25.89 
 
 		 799 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  25.56 
 
 		 941 aa  85.1  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  25.23 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  23.63 
 
 		 741 aa  74.7  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  24.93 
 
 		 680 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  25.53 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  25.53 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  38.21 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  38.21 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  23.84 
 
 		 790 aa  67.4  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  26.18 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  37.19 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  36.04 
 
 		 472 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  34.65 
 
 		 488 aa  60.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.22 
 
 		 2449 aa  56.6  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  15.07 
 
 		 423 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 		 341 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.24 
 
 		 3409 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  23.99 
 
 		 459 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  44.2 
 
 		 602 aa  52.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  20.39 
 
 		 489 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  20.38 
 
 		 484 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  21.25 
 
 		 630 aa  49.7  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  35.23 
 
 		 437 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  27.95 
 
 		 466 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  18.48 
 
 		 3521 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1246 aa  45.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  33.56 
 
 		 331 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  20.53 
 
 		 3471 aa  44.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  20.53 
 
 		 3472 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>