66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1306 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  49.17 
 
 		 784 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  100 
 
 		 848 aa  1656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  25.14 
 
 		 704 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  23.88 
 
 		 848 aa  99  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  23.73 
 
 		 907 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  23.73 
 
 		 857 aa  92.8  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  23.73 
 
 		 857 aa  92.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  24.25 
 
 		 915 aa  90.5  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  24.14 
 
 		 874 aa  89.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  31.79 
 
 		 925 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  28.42 
 
 		 740 aa  87.8  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  24.14 
 
 		 871 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  25.65 
 
 		 769 aa  84  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  25.97 
 
 		 904 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  23.65 
 
 		 941 aa  82  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  24.93 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  27.6 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  24.72 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  26.13 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  24.29 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  23.48 
 
 		 856 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  32.93 
 
 		 719 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  23.22 
 
 		 856 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  24.05 
 
 		 855 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  26.8 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  24.86 
 
 		 835 aa  69.3  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  17.15 
 
 		 939 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  26.14 
 
 		 762 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  26.49 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  26.49 
 
 		 799 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  23.87 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  23.87 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48676  predicted protein  22.34 
 
 		 4825 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  27.27 
 
 		 639 aa  59.7  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  25.97 
 
 		 790 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  33.55 
 
 		 331 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  34.59 
 
 		 487 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  24.36 
 
 		 741 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  35.04 
 
 		 485 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  35.04 
 
 		 473 aa  54.7  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  29.77 
 
 		 754 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  32.48 
 
 		 472 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  22.78 
 
 		 958 aa  53.5  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  23.7 
 
 		 209 aa  52.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  28.93 
 
 		 488 aa  52.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  36.7 
 
 		 794 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  19.62 
 
 		 914 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  34.68 
 
 		 332 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  36.67 
 
 		 334 aa  51.2  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  36.29 
 
 		 330 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49618  predicted protein  26.87 
 
 		 958 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 657 aa  50.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  39.13 
 
 		 333 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  30.37 
 
 		 437 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  39.13 
 
 		 333 aa  50.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  23.41 
 
 		 680 aa  49.7  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43680  predicted protein  17.39 
 
 		 1458 aa  49.3  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.16765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  28.16 
 
 		 466 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  30.17 
 
 		 341 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  23.56 
 
 		 9529 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  22.61 
 
 		 786 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4874  spore germination protein GerHA  29.36 
 
 		 734 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1050  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1246 aa  44.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  36.64 
 
 		 313 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1058  hypothetical protein  19.79 
 
 		 746 aa  44.7  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.506927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>