45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4613 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  852    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  43.22 
 
 		 466 aa  308  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  43.36 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  37.53 
 
 		 490 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  34.12 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  33.24 
 
 		 487 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  27.65 
 
 		 488 aa  133  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  39.91 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  39.91 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  47.1 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  36.36 
 
 		 704 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  48 
 
 		 907 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  48 
 
 		 857 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  46.67 
 
 		 857 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  48 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  48 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  45.33 
 
 		 915 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  33.54 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  34.55 
 
 		 835 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  38.83 
 
 		 857 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  34.86 
 
 		 787 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  38.1 
 
 		 842 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  44 
 
 		 855 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  36.89 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  36.89 
 
 		 856 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  44 
 
 		 858 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  39.18 
 
 		 904 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  38.46 
 
 		 941 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  43.42 
 
 		 874 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  44.59 
 
 		 762 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  35.9 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  36.67 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  43.42 
 
 		 871 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  32.14 
 
 		 680 aa  60.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  32.14 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  44.74 
 
 		 799 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  44.74 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  35.83 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  29.82 
 
 		 741 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  37.61 
 
 		 769 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  44.83 
 
 		 790 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  35.23 
 
 		 784 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  37.18 
 
 		 846 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58253  RLR1 (THO2)  25.13 
 
 		 1574 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.247117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  35.29 
 
 		 501 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>