50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3315 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  100 
 
 		 787 aa  1546    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  68.61 
 
 		 799 aa  868    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  69.24 
 
 		 799 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  58.23 
 
 		 941 aa  525  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  55.97 
 
 		 835 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  42.28 
 
 		 848 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  43.92 
 
 		 907 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  54.19 
 
 		 874 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  52.73 
 
 		 857 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  49.41 
 
 		 857 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  53.99 
 
 		 871 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  42.43 
 
 		 856 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  41.49 
 
 		 857 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  41.72 
 
 		 856 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  52.82 
 
 		 915 aa  446  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  51.26 
 
 		 904 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  42.04 
 
 		 858 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  42.99 
 
 		 855 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  48.63 
 
 		 846 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  48.9 
 
 		 769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  51.18 
 
 		 842 aa  392  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  62.38 
 
 		 367 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  62.38 
 
 		 367 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  45.15 
 
 		 639 aa  339  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  44.19 
 
 		 719 aa  327  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  40.57 
 
 		 740 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  45.43 
 
 		 790 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  36.89 
 
 		 680 aa  191  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  32.33 
 
 		 704 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.59 
 
 		 784 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  25.87 
 
 		 459 aa  101  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  35.8 
 
 		 438 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  40.94 
 
 		 472 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  35.45 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  53.25 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  35.23 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  33.5 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  35.61 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  33.5 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  25.25 
 
 		 848 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  33.59 
 
 		 488 aa  72.4  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  24.65 
 
 		 3409 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  44.09 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.36 
 
 		 3521 aa  64.7  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.48 
 
 		 2449 aa  59.7  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  26.55 
 
 		 3472 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  26.55 
 
 		 3471 aa  60.1  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  26.45 
 
 		 2914 aa  56.6  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  34.78 
 
 		 464 aa  55.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  29.55 
 
 		 209 aa  55.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>