57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2953 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1032  putative prolin-rich transmembrane protein  81.3 
 
 		 874 aa  1119    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2832  translation initiation factor 2  57.82 
 
 		 857 aa  735    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2894  hypothetical protein  57.82 
 
 		 857 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1086  hypothetical protein  53.5 
 
 		 855 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0962  hypothetical protein  52.74 
 
 		 856 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2217  hypothetical protein  52.57 
 
 		 904 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1045  hypothetical protein  52.37 
 
 		 858 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.750877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1681  RE17165p  54.53 
 
 		 915 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4200  hypothetical protein  53.08 
 
 		 857 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2944  putative prolin-rich exported protein  52.71 
 
 		 907 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2953  putative prolin-rich transmembrane protein  100 
 
 		 871 aa  1704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0789  putative prolin-rich transmembrane protein  59.55 
 
 		 848 aa  845    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0494509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0966  hypothetical protein  53.11 
 
 		 856 aa  717    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0894  hypothetical protein  70.14 
 
 		 367 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.357684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2520  translation initiation factor 2  70.14 
 
 		 367 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3315  putative prolin-rich transmembrane protein  50.95 
 
 		 787 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534129  normal  0.208628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3510  putative proline-rich transmembrane protein  43.47 
 
 		 799 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000863907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3185  putative prolin-rich transmembrane protein  52.87 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3271  putative prolin-rich exported protein  46.42 
 
 		 846 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3655  putative chromosome segregation ATPase  46.27 
 
 		 941 aa  412  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.228794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3975  hypothetical protein  46.6 
 
 		 835 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.584669  hitchhiker  0.0089061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4325  putative prolin-rich exported protein  45.57 
 
 		 769 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4074  putative chromosome segregation ATPases  52.25 
 
 		 842 aa  385  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.307372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4463  putative proline-rich transmembrane protein  44.22 
 
 		 762 aa  361  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.364594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4954  putative chromosome segregation ATPase  50.13 
 
 		 639 aa  343  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2294  putative proline-rich transmembrane protein  40.26 
 
 		 719 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4013  hypothetical protein  46.53 
 
 		 790 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4100  hypothetical protein  37.53 
 
 		 740 aa  268  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0509  hypothetical protein  36.91 
 
 		 741 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0895  hypothetical protein  45.87 
 
 		 464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2637  hypothetical protein  35.11 
 
 		 680 aa  191  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2528  hypothetical protein  32.7 
 
 		 704 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1357  hypothetical protein  26.7 
 
 		 784 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2521  translation initiation factor 2  37.36 
 
 		 372 aa  107  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1306  putative chromosome segregation ATPase  24.27 
 
 		 848 aa  89.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  normal  0.11952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3360  hypothetical protein  24.92 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2265  hypothetical protein  40.8 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.184609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4200  hypothetical protein  32.26 
 
 		 438 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156411  normal  0.730059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1125  hypothetical protein  44.74 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  37.31 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4613  hypothetical protein  34.29 
 
 		 437 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0784  hypothetical protein  33.92 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0460  FHA domain-containing protein  41.23 
 
 		 341 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2318  hypothetical protein  37.27 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0293143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2406  hypothetical protein  37.27 
 
 		 485 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1548  hypothetical protein  37.97 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  31.21 
 
 		 3242 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1219  hypothetical protein  30.73 
 
 		 586 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  23.93 
 
 		 484 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  21.26 
 
 		 489 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3389  hypothetical protein  30.77 
 
 		 209 aa  54.7  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  17.22 
 
 		 3521 aa  52  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0597  Sporulation domain protein  23.77 
 
 		 287 aa  49.3  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  16.67 
 
 		 3409 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  18.03 
 
 		 3472 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  18.03 
 
 		 3471 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4844  spore germination protein gerIA  23.29 
 
 		 754 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0520951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>